Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn2Q68FG2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms