Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kiaa1549Q68FD9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms