Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbr1Q64336 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbr1Q64336 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms