Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6eQ64253 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms