Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zfp248Q640N4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zfp248Q640N4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zfp248Q640N4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zfp248Q640N4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zfp248Q640N4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Zfp248Q640N4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zfp248Q640N4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zfp248Q640N4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Zfp248Q640N4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Zfp248Q640N4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Zfp248Q640N4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Zfp248Q640N4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Zfp248Q640N4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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