Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab34Q64008 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab34Q64008 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab34Q64008 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab34Q64008 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab34Q64008 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab34Q64008 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab34Q64008 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab34Q64008 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab34Q64008 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab34Q64008 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms