Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms