Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5dQ62240 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Kdm5dQ62240 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms