Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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