Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Npm1Q61937 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Npm1Q61937 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Npm1Q61937 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms