Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hes3Q61657 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Hes3Q61657 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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