Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli3Q61602 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms