Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms