Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PcolceQ61398 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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