Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BcanQ61361 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BcanQ61361 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BcanQ61361 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BcanQ61361 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms