Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf9Q61179 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf9Q61179 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms