Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TmpoQ61033 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TmpoQ61033 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms