Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf3Q60980 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms