Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik1Q60934 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms