Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DbpQ60925 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DbpQ60925 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DbpQ60925 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms