Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms