Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PmelQ60696 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmelQ60696 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms