Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Foxd4Q60688 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms