Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2aQ60648 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2aQ60648 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms