Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CttnQ60598 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms