Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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