Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brip1Q5SXJ3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms