Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms