Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms