Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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