Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms