Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5431Q5NCB3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5431Q5NCB3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms