Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm12253Q5NC48 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm12253Q5NC48 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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