Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms