Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm3Q5F4S9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms