Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Spag9Q58A65 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spag9Q58A65 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms