Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Znf608Q56A10 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Znf608Q56A10 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Znf608Q56A10 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Znf608Q56A10 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf608Q56A10 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf608Q56A10 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms