Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms