Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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