Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc1cQ4KL78 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc1cQ4KL78 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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