Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms