Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms