Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms