Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrfip1Q3UZ39 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrfip1Q3UZ39 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms