Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaaf3Q3UYV8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms