Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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Kdm5aQ3UXZ9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5aQ3UXZ9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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