Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms