Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1lQ3USQ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms