Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc9Q3USL1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc9Q3USL1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms