Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28047Q3US59 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms